支线航空的发展并非单凭某个支线机场、地方政府或航空公司一己之力可以办到的。不少支线机场与地方政府拿出专项航空资金，却发现其间落实运力、获得干线机场时刻等的困难非经济手段能够解决；航空公司有心开拓新航线和市场，却限于资源和政策，无法引进合适的运力。因此，在国家层面，由民航主管部门牵头，引导支线航空的发展，将比各自为战更有效率。
整合资源的其核心思路就是将支线航空与其它利益相结合，改变支线航空价值洼地的现状，让具体执行的航空公司看到持续的经济利益，调动其积极性。例如新开航线的三年保护期，以及盈利航线航权、重点机场时刻等与贫瘠航线的搭配政策，都对支线航空起到了促进作用。
今年1月1日起旅客乘坐支线飞机执飞航班，免收机场建设费就是很好的案例，尽管与原标准相比只有10元。以此为契机，设想如果不单单按机型而是按航线，将免收的范围扩大到低客流量机场所有进出港航线上，是不是将惠及更多旅客，使其享受到航空出行便利呢？
当然，通过适当的公众关系沟通，普及民航知识，让旅客逐渐转变对“大飞机、喷气机”的消费心理，摒弃对“小飞机、螺旋桨飞机”的固有偏见，也是整合资源，促进支线航空发展的重要内容之一。